واحد آکادمی انجمن اتیسم ایران در بخش پژوهشی خود آمادۀ همکاری با دانشجویان، کارشناسان و پژوهشگرانی است که قصد تحقیق در حیطۀ اتیسم را داشته باشند. این واحد در زمینه‌های گوناگون پژوهشی به دانشجویان و محققان مشاوره ارائه می‌کند. همچنین در راستای اجرای طرح‌های تحقیقاتی، پروپوزال‌های ارسال شده به آکادمی اتیسم پس از تصویب در شورای علمی قابلیت اجرا در انجمن اتیسم ایران را خواهد داشت.